无菌室，又叫无尘室。其主要功能是室内控制污染。如果没有洁净室，污染敏感零件就没有办法批量的生产。无菌室应该要有密封良好的空间，空气洁净度、湿度、温度、压力、噪声等参数可以根据具体的需要控制。
无菌室的基本要求：
(1)无菌室应有内外两间。内室为无菌室，外室为缓冲室。房间的容积不适合过于大，以方便空气杀菌。内面积2x2.5=5m平方，外面积1x2=2平方，以2.5m以下最适宜，应该有吊顶。
(2) 无菌室的内门应设置，以减少空气波动，门应该设置位于离工作台较远的位置上。中间的门必须要采用推拉门需要从里面中间比较远的位置上面设置进去。
(3) 无菌室应该在分隔内室与外室的墙壁或“隔墙”上开一扇小窗，为接种过程中物品的内外传递提供必要的通道，这样可以减少内室进出人数，降低污染程度。
(4)无菌室的体积应该小而密闭，使用一段时间了以后，室内温度很高，所以应该设置通风窗。
